Szatellita
DNS
Elnevezés: DNS reasszociációs vizsgálat végén egy csíkba (kísérő, szatellita)
tömörült frakció.
Felépítés: 5-200 bp hosszú szakaszok ismétlődnek egymás után egy hosszú (>106
bp) sorozatban. A kromoszóma nem átíródó heterokromatin régiójában fordulnak
elő.
Példa: A leggyakoribb szatellita szekvencia az emberi genomban az
satellita
DNS. Ebben egy 171 bp hosszú egység ismétlődik 105 - 106
bp hosszúságú szakaszon az összes kromoszóma centromeron régiójában..
Miniszatellita DNS: 5-50 bp ismétlődik közepes hosszúságú (104) szakaszokban. Két fontos típusa a telomerikus DNS és a hipervariábilis miniszatellita DNS.
Telomerikus DNS: Minden eukariota kromoszóma végein megtalálható. Emberben az 5' TTAGGG 3' szakasz ismétlődik 10-15 kb hosszúságú szekvenciában.
A hipervariábilis miniszatellita DNS jellemző szekvenciája 5' GGGCAGGANG 3', ahol N bármilyen bázis lehet. Ezen a szakaszon nagyon gyakori a homolog kromoszómák közötti rekombináció. A szakasz hossza egyenlőtlen átkapcsolódás következtében nagy valószíinűséggel megváltozik, ezért hosszúságában rendkívül polimorf, és egyedek azonosítását teszi lehetővé (DNS ujjlenyomat).
Mikroszatellita DNS: 1-4 bp ismétlődése > 200 bp hosszú szakaszokban szétszórva a genomban. Eloszlásuk és rendkívül magas polimorfizmusuk miatt alkalmas markereknek bizonyultak gének térképezésében