Történeti áttekintés
DNS
A genom szerveződése
A genom megváltozása
Módszerek
Mendeli genetika
Populáció-genetika
Példatár
Matematikai alapok
Bioinfo
DNS törzsfa rekonstrukció

Genetika >alcím

SALVE 1% Hardy - Weinberg egyensúly (Kabai Péter)
Általános ismertetés
 
   

Az allélgyakoriságok stabilitása ideális populációkban

Egy ideális populációban minden egyed azonos valószínűséggel párosodhat bármely más egyeddel (pánmixis). Mivel az egyedek párválasztásának modellünkben nincs hatása a következő nemzedék allélgyakoriságára, az allélgyakoriság kizárólag a gamétákban lévő allélek gyakoriságától függ. (A szemléletesség kedvéért elképzelhetünk egy óriási tavat, amelyben nagyon sok hal él. A nőstények és hímek párzáskor a vízbe eresztik ivarsejtjeiket, amelyek eredetüktől függetlenül, véletlenszerűen egyesülnek.)

Vizsgáljuk egyetlen lokusz két alléljának (A és a) gyakoriságát két egymást követő generációban. Az első generációban legyen A allél relatív gyakorisága p(A), a allélé pedig q(a). A két relatív gyakoriság összege 1, tehát p = 1 - q. Egy gaméta vagy az egyik, vagy a másik allélt hordozza, így az A allélt hordozó gaméták gyakorisága p, az a allélt hordozó gaméták gyakorisága q. Milyen arányban lesz jelen A és a allél a következő generáció gamétáiban?

AA genotípusú zigóta akkor jön létre, ha két A allélt hordozó gaméta találkozik. Két A allélt hordozó gaméta találkozásának valószínűsége p x p= p2 . Ugyanígy, aa genotípusú zigóták q2 valószínűséggel keletkeznek. Aa genotípusú egyedek kétféleképpen jöhetnek létre: egyrészt úgy, hogy A allélt hordozó hímivarsejt találkozik a allélt hordozó petesejttel, aminek valószínűsége p x q, illetve úgy, hogy a allélt hordozó hímivarsejt találkozik A allélt hordozó petesejttel, aminek valószínűsége q x p. A két valószínűség összege 2pq.

 
p (A)
q (a)
p (A)
p2 (AA)
pq (Aa)
q (a)
pq (Aa)
q2 (aa)

Az egyes genotípusok létrejöttének valószínűsége és így arányuk a populációban a következőképpen várható:

p2AA + 2pqAa + q2aa = 1. (1)

azaz

(p + q)2 = 1

Mi lesz ennek a generációnak a gamétáiban A és a allélok gyakorisága? Vizsgáljuk meg, hogy mi lesz az A allél gyakorisága a gamétákban. A allélt tartalmaz minden AA genotípusú egyed gamétája, ennek előfordulási valószínűsége p2, és A allélt hordoz az Aa genotípusú egyedek gamétáinak fele, azaz 2pq /2 = pq . Az A allélt hordozó gaméták arányának összegét osztjuk az összes gaméta gyakoriságával a kérdéses arány megállapításához:

      p2 + pq
----------------- = p2 + pq = p2 + p(1-p) = p. (2)
  p2 + 2pq + q2

Ideális populációban az utódnemzedékben az allélek gyakorisága azonos a szülői nemzedék allélgyakoriságával. Az allélgyakoriságok állandóságának tételét egymástól függetlenül két kutató bizonyította, nevük után az összefüggést Hardy-Weinberg aránynak, vagy Hardy-Weinberg egyensúlynak nevezik.

Hardy brit matematikus volt, és sok érdekes anekdota lelhető fel róla. Eredeti cikke a Salve Könyvtárban olvasható. Weinberg német orvos volt, akiről semmit sem találtam. Aki rábukkan valami megbízható forrásra, értesítsen.

A Hardy-Weinberg arányt egyetlen lokusz két alléljának gyakoriságára vezettük le. Több allélt feltételezve, amelyeknek gyakorisága p, q, r, ...n stb. is kiszámítható az elméletileg várt allélarány:

 
p1 (A1)
p2 (A2)
p3 (A3)
...........
pn (An)
p1 (A1)
p12(A1 A1)
p1 p2 (A1 A2)
p1 p3 (A1 A3)
...........
p1 pn (A1 An)
p2 (A2)
p1 p2 (A1 A2)
p22(A2 A2)
p2 p3 (A2 A3)
...........
p2 pn (A2 An)
p3 (A3)
p1 p3 (A1 A3)
p2 p3 (A2 A3)
p32(A3 A3)
...........
p3 pn (A3 An)
...........
...........
...........
...........
...........
...........
pn (An)
p1 pn (A1 An)
p2 pn (A2 An)
p3 pn (A3 An)
...........
pn2(An An)

(p1 + p2 + p3 + ... + pn)2 = 1

Bizonyítottuk tehát, hogy ideális populációkban az allélgyakoriság generációról generációra állandó. A tételt a gyakorlati munkában több kérdés megválaszolásához alkalmazhatjuk.

1. A genetikai egyensúly vizsgálata. Adott lokusz alléljainak gyakoriságának ismeretében vizsgálhatjuk, hogy érvényesül-e a Hardy-Weinberg arány. A gyakorlatban az empirikus arányokat chi2 próbával ellenőrizzük. A Hardy-Weinberg aránytól való szignifikáns eltérés esetén feltételezhetjük, hogy a vizsgált lokuszra nézve a populáció nem ideális, tehát pl. a párosodás nem véletlenszerű (aszortatív párosodás), az egyedek száma nagyon kicsi (genetikai sodródás), vagy a zigóták életben maradási esélye attól is függ, hogy a lokusz mely allélját hordozzák (szelekció). Az eltérés pontos oka csak további vizsgálatokkal deríthető ki.

Előfordulhat az is, hogy az eltérés csak látszólagos, mert az arányokat torzítja a vizsgálati mintavétel. Pl. egy galambpopulációban lehet, hogy azért tapasztalunk meg a vártnál nagyobb arányban fehér színű egyedeket, mert ezeket az átlagosnál nagyobb valószínűséggel vesszük észre. Látszólagos eltérést okozhat az is, ha a mintánk valójában nem egy, hanem több kisebb populációból származik, amelyek különböznek az allélgyakoriságban. Ebben az esetben, bár minden részpopulációban érvényesülhet a H-W arány, ha az egyes részpopulációkat a mintánk nem arányosan reprezentálja, az empirikus arány eltérhet a H-W egyensúly alapján várt értéktől (Wahlund hatás).

Amennyiben a tapasztalati allélgyakoriság nem tér el a Hardy-Weinberg aránytól, még nem lehetünk biztosak abban, hogy a vizsgált populáció ideálisnak tekinthető. A chi2 próba ugyanis meglehetősen robusztus, és a valóságos, de kismértékű eltérések nem lesznek szignifikánsak. A gyakorlati munkában e nehézségek miatt a H-W arány érvényesülése önmagában még nem bizonyítja, hogy a populáció genetikai egyensúlyban van.

2. Az allélgyakoriságok becslése. Vizsgálatainkban gyakran a látható fenotípusok aránya alapján becsüljük az allélek gyakoriságát. Domináns-recesszív öröklésmenet esetén azonban a két domináns allélt hordozó egyedek és a heterozigóták fenotípusa nem különbözik egymástól. Hardy-Weinberg arányt feltételezve egy populációban kiszámíthatjuk a domináns allél arányát a recesszív homozigóta genotípus arányának ismeretében. Mivel tapasztalatok szerint a természetes populációk csak ritkán térnek el nagymértékben a H-W aránytól, a H-W arány alapján számított allélgyakoriságok jó becslést adnak.
 


Gyakorló feladatok

Link: Pásztor Erzsébet írása az Élet és Tudományban www
Hardy eredeti Science közleménye a Salve Könyvtárban.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Szerző: {auth}
Szerkesztő:{edit}
Megírás: dátum
Módosítás: .

 

 

 

 

 

 

 

{out}