Szerkezeti családok adatbázisai

Hierarchia:

• Fold : kb. azonos lefutású polipeptidlánc, jelentős szerkezeti hasonlóság
• Főcsalád (superfamily): valószínűleg evolúciós rokonság, alacsony szekvencia-hasonlóság
• Család: >30 % szekvenciaazonosság, közös eredet

SCOP - http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop

Pl.Protein: Dystrophin from Human ( Homo sapiens )

Lineage:

Root: scop

Class: All alpha proteins [46456]

Fold: EF Hand-like [47472]
core: 4 helices; array of 2 hairpins, opened

Superfamily: EF-hand [47473]
Duplication: consists of two EF-hand units: each is made of two helices connected with calcium-binding loop

Family: EF-hand modules in multidomain proteins [47547]

Protein: Dystrophin [47559]
probably lost calcium-binding function; contains extra helices in each domain

Ugyanebben a családban van még : Phosphoinositide-specific phospholipase C, Cbl, alpha-Actinin

CATH - www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath_new/index.html